Lentoaseman kiitotien päällystystyön suurimmat työvaiheet ajoitetaan kesälle, jolloin lentoasemalla on muita ajankohtia vähemmän lentoliikennettä. Joensuun lentoasema on remontin vuoksi suljettuna 22.6.–9.7.2020 välisen ajan. Hiljaisena ajankohtana korjaustöistä toivotaan aiheutuvan mahdollisimman vähän haittaa matkustajille ja operaattoreille.
Päällystystyön yhteydessä laajennetaan lisäksi kiitoteiden päissä olevia turva-alueita. Nyt tehtävän remontin kokonaiskustannus on noin 1,1 miljoonaa euroa.
Joensuun lentoasemalta on säännöllistä reittiliikennettä Helsinkiin, minkä lisäksi lentoasemalta lennetään tilauslentoja erityisesti Euroopan lomakohteisiin. Vuonna 2019 Joensuun lentoaseman kautta matkusti yli 126 000 matkustajaa, mikä tekee siitä matkustajamäärässä mitattuna Finavian kymmenenneksi vilkkaimman lentoaseman.